Миссией Саяно-Шушенского филиала СФУ является: обеспечение опережающей фундаментальной и практической подготовки специалистов в области гидроэнергетики в единстве научной и учебной деятельности, сочетая традиции и инновации и реализуя эффективную систему качества;разработка и реализация образовательных программы совместно с ведущими специалистами Сибирского федерального университета и др.