История Института экономики берет свое начало с 11 июня 1997 года. Первоначально он функционировал как факультет. В связи с реорганизацией НИУ БелГУ в 2013 году экономический факультет был преобразован в Институт экономики, Институт экономики является одним из ведущих структурных учебных подразделений НИУ «БелГУ».